会计集中核算制是指财政部门成立会计核算中心在单位资金所有权、使用权利财务自主权不变的前提下取消单位银行账户、会计和出纳，各单位只设报账员，通过会计委托代理记账，对行政事业单位集中办理会计核算业务，融会计核算，监督、服务于一体的会计委派形式。它的运行并不改变各单位的预算管理体制、理财机制和会计主体法律责任，主要表现在：年度经费预算仍由各单位自己编报，经财政审核后批复给各单位，同时抄送会计核算中心：资金的使用权和审批权还在各单位；单位的各项收支也由领导审批并承担相应的会计法律责任。 笔者通过几年来的实践，认为实行会计集中核算是财政体制改革的一项新举措，改变了以往由各单位分散核算的管理方式，统一集中核算，变“暗箱”操作为“阳光”操作，对加强财务管理，规范会计工作行为，防止现象的产生等方面起到了积极作用，取得了一定成效。主要表现在：
1、规范会计行为，提高了会计信息质量和工作效率
实行会计集中核算后，取消了单位的资金帐户，其会计业务全部纳入核算，中心统一核算，由核算中心在银行开设统一的帐户，实行集中管理，中心选配业务素质较高的专职会计，并运用会计电算化系统，严格按照同家会计制度进行核算。改变了过去单位会计在核算时随意或有意截留收入、转移收入、改变资金用途、任意使用会计科目的现象，纠正了原来那种账户设置乱、银行开户乱、会计档案乱的“三乱”现象，从而大大提高了会计核算工作的质量和会计工作效率，保证了会计核算资料的真实性、完整性、及时性和统一性。
2、端正经费开支渠道，提高资金的使用效益。
通过核算中心对单位每笔资金的审核，使得不合规定的票据及不合理的开支不再出现，并对那些超范围，超标准，变相搞福利的违纪，违规支出予以坚决拒付，从而净化了支出项目，确保年度预算的执行及指定项目的落实。这种“单位用钱，财政管理”的方式，不仅支出得到有效控制，而且从根本上杜绝了预算执行过程中挤占、挪用、截留、浪费现象的发生，有效遏制了一些单位滥发钱物、大吃大喝等不合法行为，提高了资金的使用效益，保证了财政资金的安全。仅2006年1—9月份我市市直系统会计核算中心就核减支出44．93万元。
3、加强了会计监督，从源头上预防和遏制现
实行会计集中核算后，会计人员隶属关系全部转到核算中心，使得会计人员可以依法独立履行职责，增强了会计人员进行监督的自觉意愿，使会计人员敢于对会计资料进行全过程监督，使得资金的使用管理由以前的事后监督转为事前、事中、事后的全方位和全过程的监控，消除了财政监督的死角．从而有效地阻止单位财务收支中违规违法行为的发生，杜绝不合理的支出，解决了财政监督与管理上的“缺位”、“滞后”问题。
会计的集中核算是加强会计基础工作、财政资金管理的一项新举措，在它的初始阶段和任何新生事物—样，也必然存在其局限性和不够完善的地方。归结起来有以下几点：
1、实物资产管理的缺位，削弱了会计管理职能。
集中核算将记账、算账、报账等工作进行丁集中，但资产、实物，合同等仍由原单位管理，出现了账实管理分离的现象，会计人员常年在核算中心办公，无法及时参与单位的经营活动，不利于各项财产的管理，一旦单位领导与报账员管理意识薄弱，或因工作疏忽而未向核算中心提供真实情况，核算中心将无法知晓各单位的资产存在情况，致使核算中心的账与单位实物不符。这种财产物资管理与会计核算相分离的情况势必使单位财产物资管理薄弱的问题更加突出，如果不加以解决，既违背了集中核算的初衷造成国有资产流失，又将造成新的之源。
2、配套制度的相对落后，在一定程度上增加了操作难度。
由于现行的财务制度中费用报销的标准，大多数制定于二十世纪八九十年代，有的开支规定不够具体，有的标准偏低，同当前的经济水平和实际情况有着差距。例如差旅费标准、住宿费报销等等。这是会计集中核算实践中，最为突出的矛盾之一。如何把握好既坚持规章制度，以达到节约经费，提高资金使用效益的目的，又实事求是地处理好实际开支的报销问题，以保证行政事业单位正常业务活动的开展，这是对中心工作人员业务素质和职业判断能力的严峻考验。